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Introduction La stratégie de dépistage réactif autour d'un cas de COVID-19 était recommandée durant l'hiver 2021-22 dans les écoles en France. La réalisation de dépistages itératifs, permet d'identifier l'ensemble des cas prévalents avec un impact pouvant être différent sur la transmission et la fermeture de classes. L'objectif était d'estimer la faisabilité et l'impact d'une campagne de dépistages itératifs des infections à SARS-CoV-2 en milieu scolaire sur le nombre de cas qui auraient été identifiés en l'absence de cette campagne. Matériels et méthodes Une campagne de dépistages itératifs du SARS-CoV-2 a été expérimentée dans 31 écoles (400 classes) de 4 départements d'une région française entre les semaines [S]47-2021 et S6-2022. Après consentement, les élèves volontaires étaient invités chaque semaine à réaliser un autotest par kit salivaire pour RT-PCR réalisée par les laboratoires de proximité. Un cas était un enfant ayant un test salivaire positif après RT-PCR SARS-CoV-2 réalisé dans ce cadre. Un questionnaire hebdomadaire était complété par le directeur d'établissement. Le nombre de cas attendus a été estimé par l'incidence communautaire par âges scolaires (2-5 ans, 6-10 ans) dans le département de chaque école. Le rapport entre le nombre de cas observés lors des dépistages itératifs/attendus en l'absence de dépistages itératifs [O/A] a été calculé par niveau scolaire et semaine. Résultats Parmi les 7 écoles maternelles, 18 élémentaires et 6 mixtes participantes aux dépistages itératifs, 35573 tests ont été réalisés et 1192 étaient positifs (taux de positivité [TP]=3,3%), avec un taux de participation de 66,1%. La participation était la plus élevée entre les S47-2021 à S50. Entre les semaines 2021-47 et 2021-50, 231 infections ont été identifiées par les tests itératifs, dont 204 (88%, TP=1,4%, taux de dépistage [TD]=67,7%) en écoles élémentaires et 27 (12%, TP=0,7%, TD=53,1%) en écoles maternelles alors que 320 cas y étaient attendus (-89 cas) soit une diminution de -27,8% des cas d'infection à SARS-CoV-2 chez les enfants des écoles participantes aux dépistages itératifs par rapport aux cas attendus en l'absence de cette campagne (ratio O/A=0,7). Pour la totalité de l'étude (S47-2021 à S6-2022), cette diminution se maintient à -19,5% dans les 8 établissements ayant poursuivi la campagne (1289 cas auraient pu survenir dans ces écoles alors que 1 038 y ont été identifiés grâce à la campagne de dépistages itératifs [-251 cas, ratio O/A=0,8]). Conclusion Les dépistages organisés itératifs du SARS-CoV-2 en milieu scolaire par prélèvement salivaire sont faisables et bien acceptés mais nécessitent une forte implication des acteurs. L'étude suggère un avantage de la stratégie de dépistages itératifs en école pour limiter le nombre d'infections par le SARS-CoV-2 chez les élèves, comparativement aux dépistages réactifs. Aucun lien d'intérêt
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Objective: Pregnancy is a risk factor for acute respiratory failure (ARF) following severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection. We hypothesised that SARS-CoV-2 viral load in the respiratory tract might be higher in pregnant intensive care unit (ICU) patients with ARF than in non-pregnant ICU patients with ARF as a consequence of immunological adaptation during pregnancy. Design: Single-centre, retrospective observational case- control study. Setting: Adult level 3 ICU in a French university hospital. Participants: Eligible participants were adults with ARF associated with coronavirus disease 2019 (COVID-19) pneumonia. Main outcome measure: The primary endpoint of the study was viral load in pregnant and non-pregnant patients. Results: 251 patients were included in the study, including 17 pregnant patients. Median gestational age at ICU admission amounted to 28 + 3/7 weeks (interquartile range [IQR], 26 + 1/7 to 31 + 5/7 weeks). Twelve patients (71%) had an emergency caesarean delivery due to maternal respiratory failure. Pregnancy was independently associated with higher viral load (-4.6 +/- 1.9 cycle threshold;P < 0.05). No clustering or over-represented mutations were noted regarding SARS-CoV-2 sequences of pregnant women. Emergency caesarean delivery was independently associated with a modest but significant improvement in arterial oxygenation, amounting to 32 +/- 12 mmHg in patients needing invasive mechanical ventilation. ICU mortality was significantly lower in pregnant patients (0 v 35%;P < 0.05). Age, Simplified Acute Physiology Score (SAPS) II score, and acute respiratory distress syndrome were independent risk factors for ICU mortality, while pregnancy status and virological variables were not. Conclusions: Viral load was substantially higher in pregnant ICU patients with COVID-19 and ARF compared with non-pregnant ICU patients with COVID-19 and ARF. Pregnancy was not independently associated with ICU mortality after adjustment for age and disease severity.
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SARS CoV 2 S-glycoproteins play a crucial role in the entry steps of viral particles. Due to their surface location, they are the main target for host immune responses and the focus of most vaccine strategies. The D614G mutation identified in late January became dominant during March 2020, rendering SARS-CoV-2 more infectious. In April 2020, the Alpha, Beta and Gamma variants emerged simultaneously in Asia, South Africa, and South America, respectively. They were 1.6 to 2 times more transmissible than the ancestral strain. The currently dominant Omicron variant (BA.2) is not a direct descendant from the D614G lineage, but rather emerged from the BA.1 variant (as did BA.4 and BA.5). It is substantially different from all the other variants. It presents significantly reduced susceptibility to antibody neutralization: after 2 doses of mRNA-vaccine, neutralizing titers to Omicron are 41 to 84 times lower than neutralization titers to D614G. That said, a booster dose of mRNA-vaccine increases Omicron neutralization titers and reduces the risk of severe infection.
Asunto(s)
COVID-19 , SARS-CoV-2 , Humanos , SARS-CoV-2/genética , Pruebas de Neutralización , Anticuerpos Antivirales , Eficacia de las Vacunas , ARN Viral , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , Variación Genética , ARN MensajeroRESUMEN
France was one of the first countries to be reached by the COVID-19 pandemic. Here, we analyse 196 SARS-Cov-2 genomes collected between Jan 24 and Mar 24 2020, and perform a phylodynamics analysis. In particular, we analyse the doubling time, reproduction number (Rt) and infection duration associated with the epidemic wave that was detected in incidence data starting from Feb 27. Different models suggest a slowing down of the epidemic in Mar, which would be consistent with the implementation of the national lock-down on Mar 17. The inferred distributions for the effective infection duration and Rt are in line with those estimated from contact tracing data. Finally, based on the available sequence data, we estimate that the French epidemic wave originated between mid-Jan and early Feb. Overall, this analysis shows the potential to use sequence genomic data to inform public health decisions in an epidemic crisis context and calls for further analyses with denser sampling.
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From its emergence in December 2019 and until the end of the fourth pandemic wave in October 2021, SARS-CoV-2 circulation has been associated with significant molecular evolutions of the virus. These were linked to mutations that have led to new virus linages with replication advantages as a result of increased transmission, or partial immune escape in the context of progressively increasing global immunisation. The pandemic context with large scale epidemics massive outbreaks observed in highly populated areas has favoured this emergence of "variants". During the 20 months period, at least three evolutionary phases have been observed, leading to the situation observed in October 2021. For the first time, an unprecedented worldwide surveillance effort has been conducted to monitor the circulation of the emerging virus, with rapid data sharing. This molecular surveillance system has provided an accurate description of the circulating viruses, and their evolution. The implementation of these tools and skills able to provide SARS-CoV-2 molecular epidemiological data has upgraded the global capacity for surveillance worldwide, and may allow us to be better prepared for a future pandemic episode.
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Depuis son émergence en décembre 2019 jusqu’à la fin de la quatrième vague pandémique en octobre 2021, la circulation du SARS-CoV-2 a été associée à des évolutions moléculaires significatives du virus. Ces évolutions ont été la conséquence de mutations qui ont entraîné l’apparition de lignages présentant des avantages réplicatifs, tant par augmentation de leur transmissibilité que du fait d’un échappement partiel à la réponse immunitaire progressivement croissante. Le contexte pandémique, avec des bouffées épidémiques massives observées dans des zones de forte densité de population, a incontestablement créé des conditions favorables à l’apparition de ces « variants ». Durant ces vingt mois, au moins trois périodes évolutives peuvent être identifiées, conduisant à la situation observée en octobre 2021. C’est la première fois qu’un effort sans précédent est fait pour surveiller les virus circulant à l’échelle planétaire de manière transparente et avec un partage de données rapide. Cette surveillance moléculaire a permis la description précise des virus circulant et de leur évolution. Les outils et moyens déployés pour faire l’épidémiologie moléculaire du SARS-CoV-2 reflètent incontestablement une montée en puissance de la capacité d’analyse à l’échelle planétaire, et peuvent nous permettre d’être mieux préparés pour le prochain épisode pandémique.
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Introduction L’infection à SARS-CoV-2 est à l’origine de syndromes respiratoires aigus sévères pouvant nécessiter un recours aux soins intensifs Un des enjeux de la pandémie survenue début 2020 est de déterminer les facteurs associés à l’aggravation clinique Le lien éventuel entre le délai d’accès aux soins et la survenue de formes sévères est mal connu L’objectif de ce travail est de décrire les caractéristiques des patients hospitalisés pour infection à SARS-CoV-2 selon le délai entre le début des symptômes et l’admission en hospitalisation, afin de déterminer les caractéristiques associées à un délai court (10jours) Matériels et méthodes Ce travail repose sur les données de l’étude observationnelle, prospective, multicentrique NOSO-COR dont les objectifs étaient de décrire les cas d’infection par SARS-CoV-2 hospitalisés L’analyse a été effectuée sur les données des cas communautaires d’infection à SARS-CoV-2 inclus au sein d’un CHU français du 08/02 au 17/05/2020 Les caractéristiques démographiques, les comorbidités sous-jacentes, les paramètres cliniques et biologiques ont été collectés Le patient a été suivi jusqu’à la sortie de l’hôpital Les comparaisons entre les groupes ont été effectuées en utilisant le test de Mann–Whitney (variables quantitatives) et le test du Chi2 (variables qualitatives) Les différentes caractéristiques associées au délai entre début des symptômes et admission en hospitalisation ont été évaluées à l’aide de régression logistique ajustée sur l’âge, le sexe, les comorbidités et les principaux symptômes Résultats Huit cent vingt-deux patients ont été inclus dans l’analyse L’âge médian était de 73 ans (IQR : 61–84), 453 (55,1 %) étaient des hommes Comparés aux patients présentant un délai court entre le début des symptômes et l’hospitalisation, les patients présentant un délai long étaient plus jeunes (médiane 68 vs 82 ans, p75 ans (p100mg/L (p=0,003), l’anosmie (p=0,008) et l’agueusie (p=0,018) Conclusion Le délai entre début des symptômes et hospitalisation semble être allongé chez les patients<75 ans et ne présentant pas de comorbidités ;cette population est surreprésentée chez les patients bénéficiant d’une hospitalisation d’emblée en soins intensifs La détection des signes de gravité et l’accès précoce à l’hospitalisation pourrait être un moyen de limiter la survenue de formes cliniques sévères
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While the SARS-CoV-2 genome has remained relatively stable since its emergence, genomic deletions are a frequently described evolutionary pattern of previous coronaviruses with significant impacts on outbreaks. This was the case in with both the SARS and MERS epidemics and has also recently been described with the massive surveillance of the SARS-CoV-2 genome since its emergence. During routine molecular surveillance of SARS-CoV-2 performed at the National Reference Center of Respiratory Viruses (Lyon, France) (n=229 sequences collected Feb-April 2020), two frameshifting deletions were detected in the open reading frame 6, starting at the same position (27267). While a 26-nucleotide deletion variant (D26) was only found in one nasopharyngeal sample in March 2020, the 34-nucleotide deletion variant D34) was found within a single geriatric hospital unit in 5/9 patients and one health care worker in April 2020. Phylogeny analysis strongly suggested a nosocomial transmission between patients for D34, with potential fecal transmission, as D34 was also identified in a stool sample. No difference in disease severity was observed within the patients hospitalized in the geriatric unit and infected with WT (n=4) or D34 (n=5). In vitro characterization of D26 and D34 revealed comparable replication kinetics with the wild-type (WT), but differential host immune responses. While interferon-stimulated genes were similarly upregulated after infection withWTand ORF6 deletion variants, the latter specifically induced overexpression of 9 genes coding for inflammatory cytokines in the NF-kB pathway, including CCL2/MCP1, PTX3, and TNF, for which high plasma levels of these cytokines have been associated with severe Covid-19. Given the heterogeneous clinical manifestations of Covid-19 and the growing global prevelance of certain SARS-CoV-2 variants, our findings emphasize the need to monitor the occurrence of ORF6 deletions and assess their impact on the host immune response.
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BACKGROUND: The association between SARS-CoV-2 commercial serological assays and virus neutralization test (VNT) has been poorly explored in mild patients with COVID-19. METHODS: 439 serum specimens were longitudinally collected from 76 healthcare workers with RT-PCR-confirmed COVID-19. The clinical sensitivity (determined weekly) of 9 commercial serological assays were evaluated. Clinical specificity was assessed using 69 pre-pandemic sera. Correlation, agreement, and concordance with the VNT were also assessed on a subset of 170 samples. Area under the ROC curve (AUC) was estimated at 2 neutralizing antibody titers. RESULTS: The Wantai Total Ab assay targeting the receptor binding domain (RBD) within the S protein presented the best sensitivity at different times during the course of disease. The clinical specificity was greater than 95% for all tests except for the Euroimmun IgA assay. The overall agreement with the presence of neutralizing antibodies ranged from 62.2% (95%CI;56.0-68.1) for bioMerieux IgM to 91.2% (87.0-94.2) for Siemens. The lowest negative percent agreement (NPA) was found with the Wantai Total Ab assay (NPA 33% (21.1-48.3)). The NPA for other total Ab or IgG assays targeting the S or the RBD was 80.7% (66.7-89.7), 90.3% (78.1-96.1), and 96.8% (86.8-99.3) for Siemens, bioMerieux IgG, and DiaSorin, respectively. None of the commercial assays have sufficient performance to detect a neutralizing titer of 80 (AUC < 0.76). CONCLUSIONS: Although some assays show a better agreement with VNT than others, the present findings emphasize that commercialized serological tests, including those targeting the RBD, cannot substitute a VNT for the assessment of functional antibody response.
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BACKGROUND: Protracted viral shedding is common in hospitalized patients with COVID-19 pneumonia, and up to 40% display signs of pulmonary fibrosis on computed tomography (CT) after hospital discharge. We hypothesized that COVID-19 patients with acute respiratory failure (ARF) who die in intensive care units (ICU) have a lower viral clearance in the respiratory tract than ICU patients discharged alive, and that protracted viral shedding in respiratory samples is associated with patterns of fibroproliferation on lung CT. We, therefore, conducted a retrospective observational study, in 2 ICU of Lyon university hospital. RESULTS: 129 patients were included in the study, of whom 44 (34%) died in ICU. 432 RT-PCR for SARS-CoV-2 were performed and 137 CT scans were analyzed. Viral load was significantly higher in patients deceased as compared to patients alive at ICU discharge (p < 0.001), after adjustment for the site of viral sampling and RT-PCR technique. The median time to SARS-CoV-2 negativation on RT-PCR was 19 days [CI95 %:15-21] in patients alive at ICU discharge and 26 days [CI95 %:17-infinity] in non-survivors at ICU discharge. Competitive risk regression identified patients who died in ICU and age as independent risk factors for longer time to SARS-CoV-2 negativation on RT-PCR, while antiviral treatment was independently associated with shorter time. None of the CT scores exploring fibroproliferation (i.e., bronchiectasis and reticulation scores) were significantly associated with time to SARS-CoV-2 negativation. CONCLUSIONS: Viral load in respiratory samples is significantly lower and viral shedding significantly shorter in ICU survivors of COVID-19 associated acute respiratory failure. Protracted viral shedding is unrelated to occurrence of fibrosis on lung CT.
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Declaration de liens d'interets: Les auteurs declarent ne pas avoir de liens d'interets. Copyright © 2020
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Introduction Le virus du syndrome respiratoire aigu sévère à coronavirus 2 (SRAS-CoV-2), détecté pour la première fois en décembre 2019 dans la province chinoise du Hubei, a été qualifié de pandémique le 11 mars 2020. La COVID-19 est la maladie infectieuse émergente due au SRAS-CoV-2, principalement associée à une infection des voies respiratoires inférieures. Une connaissance approfondie des caractéristiques cliniques des patients COVID-19 symptomatiques lors de leur admission hospitalière est cruciale pour optimiser leur prise en charge dans ce contexte pandémique. L’objectif principal de l’étude était de décrire les caractéristiques cliniques des patients COVID-19 à l’admission et d’identifier les déterminants associés à l’admission directe ou au transfert dans les unités de soins intensifs (USI) des différents hôpitaux participants. Matériels et méthodes Cette étude est un projet ancillaire du projet NOSO-COR, une étude prospective, observationnelle, en milieu hospitalier, dont l’objectif principal est d’estimer le risque de la COVID-19 nosocomiale. Les caractéristiques démographiques, les comorbidités sous-jacentes, ainsi que les paramètres cliniques et biologiques ont été collectés. Les patients ont été suivis jusqu’à la sortie de l’hôpital ou le décès. Les comparaisons entre les groupes ont été effectuées en utilisant le test de Mann–Whitney ou Kruskall–Wallis et le test du Chi2 ou exact de Fisher, le cas échéant. Un modèle de régression multivariée a été appliquée à 374 patients pour lesquels la durée de séjour d’hospitalisation était complète et sans données manquantes. Résultats Sur les 412 patients inclus, 325 (78,9 %) sont sortis vivants de l’hôpital et 87 sont décédés à l’hôpital au moment de l’analyse. L’âge médian était de 72,0 ans [IQR : 57–83] et 56,3 % étaient des hommes. Au total, 286 patients (69,4 %) avaient un ou plusieurs comorbidités dont les plus fréquents étaient les maladies cardiovasculaires (47,6 %) et le diabètes (19,9 %). Le sexe masculin (odds ratio [OR] ajusté, 1,99 [intervalle de confiance à 95 % (IC95 %) : 1,07–3,72]), la fièvre (OR : 1,37 [IC95 % : 1,01–1,88]), une auscultation pulmonaire anormale à l’admission (OR ajusté : 2,62 [IC95 % : 1,40–4,90]) et un taux élevé de la protéine C réactive (CRP) (OR ajusté : 6,96 [IC95 % : 1,45–33,35] pour CRP>100mg/L vs CRP<10mg/L) étaient associés à un risque d’admission/transfert en USI. L’allongement du délai entre l’apparition des symptômes et l’admission à l’hôpital a été associé à un risque d’admission directe/transfert en USI (OR ajusté : 4,82 [IC95 % : 1,61–14,43] pour un délai>10jours vs un délai<3jours). La présence d’une monocytopénie était également associée à un risque d’admission directe/transfert en USI (OR ajusté : 2,49 [IC95 % : 1,29–4,82]). Conclusion La présentation clinique de l’infection par le SRAS-CoV-2 lors de l’admission à l’hôpital est associée au pronostic. Le délai entre le début des symptômes et l’admission à l’hôpital doit être considéré comme un marquer potentiel d’aggravation de l’état des patients. Un suivi médical et une prise en charge appropriée dès l’apparition des premiers symptômes permettraient d’éviter les hospitalisations tardives.
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Introduction La COVID-19, pathologie associée au syndrome respiratoire aigu sévère du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) a émergé fin 2019 et est à l’origine d’infections des voies respiratoires inférieures. Cette étude ancillaire, ancrée dans le projet NOSO-COR destiné à l’étude du risque nosocomial du SRAS-CoV-2, a pour but d’étudier les caractéristiques cliniques et biologiques à l’admission des patients COVID-19 hospitalisés. Matériels et méthodes Une étude observationnelle, prospective et multicentrique a été conduite dans un centre hospitalier universitaire de 5300 lits. Tout patient diagnostiqué positif à la COVID-19, présentant de la toux et/ou de la fièvre supérieure à 37,8° C, admis à l’hôpital et y ayant séjourné plus de 24heures a été inclus dans l’étude. Les caractéristiques sociodémographiques, les comorbidités sous-jacentes ainsi que les paramètres cliniques et biologiques à l’admission ont été recueillis. Une analyse descriptive et stratifiée selon l’âge (inférieur 60 ans, entre 60 et 80 ans et supérieur 80 ans) a été effectuée et réalisée avec le logiciel STATA 14.0®. Résultats Au total, 1121 cas ont été inclus dans l’étude NOSO-COR entre le 8/02 et le 10/06/2020 avec un pic épidémique atteint au 26/03/2020. L’âge médian était de 77 ans [IQR : 64–87], avec un sex-ratio de 1,06. Les patients étaient à 79,1 % hospitalisés en service de médecine, chirurgie et gynéco-obstétrique et 7,3 % d’entre eux ont été secondairement transférés en service de réanimation. Le taux d’admission directe en réanimation était de 18,4 %. Deux cent cinquante patients, dont 166 (66,4 %) âgés de plus de 80 ans, sont décédés (toutes causes confondues), soit un taux brut de létalité observée de 22,3 %. Les patients présentaient de la fièvre supérieure à 37,8°C, de la toux, une auscultation pulmonaire anormale et une dyspnée dans 82,5 %, 62,4 %, 59,3 % et 48,3 % des cas respectivement. De plus, 1031 (90,2 %) des patients souffraient de comorbidités, dont 566 (50,4 %) avec des antécédents cardiologiques. La moitié des patients inclus présentaient une lymphopénie, et 1/3 une protéine C réactive supérieure à 100mg/L. La durée médiane de séjour d’hospitalisation était différente selon les catégories d’âge, avec un séjour plus long chez les patients âgés de plus de 80 ans (4jours [IQR : 2–9] vs 8jours [IQR : 4–14] vs 9jours [IQR : 4–15], p<0,001). Les patients âgés de plus de 80 ans décédaient plus fréquemment (6,3 % vs 17,0 % vs 34,2 %, p<0,001). Les comorbidités cardiologiques, neurologiques et néoplasiques apparaissaient comme déterminantes selon l’âge des patients COVID-19 (p=0,001). Conclusion Face à l’émergence du SRAS-CoV-2, cette étude a permis de dresser les caractéristiques à l’admission des patients COVID-19 hospitalisés et d’étudier la dynamique de l’épidémie depuis l’apparition du 1er cas dans notre hôpital afin d’identifier les populations à risque et d’adapter la prise de décision clinique.
Asunto(s)
Secuencia de Aminoácidos/genética , Betacoronavirus/genética , Eliminación de Secuencia/genética , Proteínas no Estructurales Virales/genética , Secuencia de Bases , COVID-19 , Infecciones por Coronavirus/epidemiología , Francia/epidemiología , Genoma Viral/genética , Humanos , Pandemias , Neumonía Viral/epidemiología , SARS-CoV-2 , Análisis de Secuencia de ARN , Carga ViralRESUMEN
Introduction La détection du SARS-CoV-2 dans la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) repose sur un test par RT-PCR effectué à partir d’un écouvillon oro- ou nasopharyngé (ENP). Nous rapportons ici le cas d’un patient contact de sujets confirmés au sein du cluster des Contamines-Montjoie, Haute Savoie, qui a développé au cours de son suivi une pneumonie associée au SARS-Cov-2 diagnostiquée par une aspiration endotrachéale (AET) testée positive alors que l’ensemble des ENPs réalisés sont restés négatifs. Matériels et méthodes Les caractéristiques cliniques du patient ont été suivies quotidiennement pendant la quarantaine dans un hôpital tertiaire français. Le diagnostic du SARS-Cov-2 était basé sur un test par RT-PCR développé par le Centre National de Référence pour les virus respiratoires ciblant le gène RdRp. D’autres pathogènes pulmonaires ont été recherchés en utilisant un FilmArray® RP2+(BioFire Diagnostics, SLC, États-Unis). Résultats Un homme de 53 ans avec pour seul antécédent une dyslipidémie traitée a été hospitalisé pour une mise en quarantaine après avoir été en contact avec des cas confirmés de COVID-19. À l’admission, le patient était asymptomatique et l’écouvillon nasopharyngé était négatif pour la détection du SARS-CoV-2. Au jour 5, il a présenté une fièvre isolée (38,1°C), sans signe d’infection des voies respiratoires hautes ou basses. La radiographie thoracique réalisée au jour 6 montrait un discret syndrome interstitiel bilatéral bi-basal. Une tomodensitométrie thoracique réalisée au jour 7 montrait des images éparses en verre dépoli de localisation périphérique au niveau du lobe inférieur gauche et du lobe moyen. Au niveau biologique, la seule anomalie identifiée était un minime syndrome inflammatoire (protéineC réactive à 12mg/L). La fièvre a persisté 3jours avec un maximum mesuré à 38,5°C. Les autres paramètres cliniques - dont la SpO2 - sont restés normaux, sans survenue d’autre symptôme jusqu’au jour 9, où le patient a présenté une toux sèche associée à une rhinorrhée. Une AET a été réalisée au jour 8 et est revenue positive pour le SARS-CoV-2. Ce résultat a été confirmé par un crachat induit le jour 9, tandis que l’ENP est demeuré toujours négatif. La recherche d’autres pathogènes respiratoires était négative (ENP et AET). Le suivi clinique de ce cas est toujours en cours. Conclusion Il s’agit de la première description de résultats dissociés entre un ENP négatif de manière persistante et une AET positive chez un patient atteint d’une pneumonie liée au SARS-CoV-2. Cette observation suggère que pour les patients à haut risque de COVID-19, même des symptômes bénins (comme un fébricule isolé) devraient inciter les cliniciens à effectuer une tomodensitométrie thoracique et un prélèvement des voies respiratoires inférieures pour dépister l’infection.